T-COFFEE, Version_8.99(Thu Feb 17 19:24:49 CET 2011 - Revision 594)
Cedric Notredame 
CPU TIME:6 sec.
SCORE=57
*
 BAD AVG GOOD
*
KCNQ1    :  59
KCNQ2    :  44
KCNQ3    :  45
KCNQ4    :  46
KCNQ5    :  44
KCNA1    :  55
KCNA2    :  74
KCNA3    :  65
KCNA4    :  63
KCNA5    :  60
KCNA6    :  65
KCNA7    :  72
KCNA10   :  69
KCNB1    :  47
KCNB2    :  46
KCNC1    :  52
KCNC2    :  52
KCNC3    :  46
KCNC4    :  51
KCND1    :  54
KCND2    :  54
KCND3    :  53
KCNF1    :  64
KCNG1    :  62
KCNG2    :  67
KCNG3    :  70
KCNG4    :  62
KCNV1    :  63
KCNV2    :  62
KCNS1    :  62
KCNS2    :  64
KCNS3    :  63
cons     :  57

KCNQ1        1 MA-----------------------------------A----    3 
KCNQ2        1 ------------------------------------------    0 
KCNQ3        1 ------------------------------------------    0 
KCNQ4        1 ------------------------------------------    0 
KCNQ5        1 M------------------------------------P----    2 
KCNA1        1 ------------------------------------------    0 
KCNA2        1 ------------------------------------------    0 
KCNA3        1 MD-----ERLSLLRSPPPPSARHRAHPPQRPASSG-GAHTLV   36 
KCNA4        1 ME-----VAMV-------------------SAESS-GCNSHM   17 
KCNA5        1 ME-----IALV-------------------PLENG-GAMTVR   17 
KCNA6        1 MR-----SEKS-------------------LTLAA-------   11 
KCNA7        1 M-----------------------------------------    1 
KCNA10       1 MD-----VC-GWK------------------EMEV-ALVNFD   17 
KCNB1        1 M-----------------------------------------    1 
KCNB2        1 MA----------------------------------------    2 
KCNC1        1 ------------------------------------------    0 
KCNC2        1 ------------------------------------------    0 
KCNC3        1 ML-----SSVCV-------------------SSF--------   10 
KCNC4        1 MI-----SSVCV-------------------SSY--------   10 
KCND1        1 MA-----AGLAT-------------------WLP--------   10 
KCND2        1 MA-----AGVAA-------------------WLP--------   10 
KCND3        1 MA-----AGVAA-------------------WLP--------   10 
KCNF1        1 MD----------------------------------------    2 
KCNG1        1 MT-----LLPGD-------------------NSD-YDYSALS   17 
KCNG2        1 ------------------------------------------    0 
KCNG3        1 MT-----FG---------------------------------    4 
KCNG4        1 MP-----MPSRD-------------------GGLHPRHHHYG   18 
KCNV1        1 MP----------------------------------------    2 
KCNV2        1 MLKQSERRRSWS-------------------YRPW-NTTENE   22 
KCNS1        1 ML----------------------------------------    2 
KCNS2        1 MT----------------------------------------    2 
KCNS3        1 MV----------------------------------------    2 

cons         1                                              42 


KCNQ1        4 ------------------------------------------    3 
KCNQ2        1 ------------------------------------------    0 
KCNQ3        1 ------------------------------------------    0 
KCNQ4        1 ------------------------------------------    0 
KCNQ5        3 ----------------------------------RHHA--GG    8 
KCNA1        1 ------------------------------------------    0 
KCNA2        1 ------------------------------------------    0 
KCNA3       37 NHGYAE------------------------------------   42 
KCNA4       18 PYGYAAQARARERERLAHSRAAAAAAVAAATAAVEGSGGSGG   59 
KCNA5       18 GG----------------DEARAGCGQATGG-ELQCPPTAGL   42 
KCNA6       12 -P----------------GEV-------------------RG   17 
KCNA7        2 ------------------------------------------    1 
KCNA10      18 NS----------------D-------------EIQEEP--GY   28 
KCNB1        2 ------------------------------------------    1 
KCNB2        3 ------------------------------------------    2 
KCNC1        1 ------------------------------------------    0 
KCNC2        1 ------------------------------------------    0 
KCNC3       11 -R----------------GR----------------------   13 
KCNC4       11 -R----------------GR----------------------   13 
KCND1       11 ------------------------------------------   10 
KCND2       11 ------------------------------------------   10 
KCND3       11 ------------------------------------------   10 
KCNF1        3 ------------------------------------------    2 
KCNG1       18 ------------------------------------------   17 
KCNG2        1 ------------------------------------------    0 
KCNG3        5 ------------------------------------------    4 
KCNG4       19 ------------------------------------------   18 
KCNV1        3 ------------------------------------------    2 
KCNV2       23 GSQ-----------------------------HRRSICSLGA   35 
KCNS1        3 ------------------------------------------    2 
KCNS2        3 ------------------------------------------    2 
KCNS3        3 ------------------------------------------    2 

cons        43                                              84 


KCNQ1        4 ----AS------------------------------------    5 
KCNQ2        1 ------------------------------------------    0 
KCNQ3        1 ------------------------------------------    0 
KCNQ4        1 ------------------------------------------    0 
KCNQ5        9 E---EG------------------------------------   11 
KCNA1        1 ------------------------------------------    0 
KCNA2        1 ------------------------------------------    0 
KCNA3       43 -----------P------------------------------   43 
KCNA4       60 GSHHHHQSRGACTSHDPQSSRGSRRRRRQRSEKKKAHYRQSS  101 
KCNA5       43 SDGPKEPAPKG-------------------------------   53 
KCNA6       18 P--------EG-------------------------------   20 
KCNA7        2 ------------------------------------------    1 
KCNA10      29 ATDFDSTSPKG-------------------------------   39 
KCNB1        2 ------------------------------------------    1 
KCNB2        3 ------------------------------------------    2 
KCNC1        1 ------------------------------------------    0 
KCNC2        1 ------------------------------------------    0 
KCNC3       14 ------------------------------------------   13 
KCNC4       14 ------------------------------------------   13 
KCND1       11 ------------------------------------------   10 
KCND2       11 ------------------------------------------   10 
KCND3       11 ------------------------------------------   10 
KCNF1        3 ------------------------------------------    2 
KCNG1       18 ------------------------------------------   17 
KCNG2        1 ------------------------------------------    0 
KCNG3        5 ------------------------------------------    4 
KCNG4       19 ------------------------------------------   18 
KCNV1        3 ------------------------------------------    2 
KCNV2       36 ---RSGS-----------------------------------   39 
KCNS1        3 ------------------------------------------    2 
KCNS2        3 ------------------------------------------    2 
KCNS3        3 ------------------------------------------    2 

cons        85                                             126 


KCNQ1        6 -------------------SPPRAERK--------RWGWGRL   20 
KCNQ2        1 --------------------M---------------VQKSRN    7 
KCNQ3        1 --------------------MGLKARR--------AAGAAGG   14 
KCNQ4        1 --------------------M-------------------AE    3 
KCNQ5       12 -------------------GAAGLWVK--------SGAAAAA   26 
KCNA1        1 -------------------MTVMSGE---------N------    8 
KCNA2        1 -------------------MTVATGD---------P------    8 
KCNA3       44 ----------AAGRELPPDMTVVPGD---------H------   60 
KCNA4      102 FPHCSDLMPSGSEEKILRELSEEEED---------E------  128 
KCNA5       54 ------RGAQRDADSGVRPLPPLPDP---------G------   74 
KCNA6       21 ------EQQ----D----------------------------   24 
KCNA7        2 --------------------EP-------------R------    4 
KCNA10      40 ------RPGGSSFSNGKIL-ISESTN---------H------   59 
KCNB1        2 ------------------------PA---------G------    4 
KCNB2        3 ---------------------EKAPP---------G------    8 
KCNC1        1 ------------------------------------------    0 
KCNC2        1 ------------------------------------------    0 
KCNC3       14 -----------QGASKQQPAPPPQPPESPPPPPLPP------   38 
KCNC4       14 -----------KSGNKP-------------------------   19 
KCND1       11 ---------------------FARAA---------A------   16 
KCND2       11 ---------------------FARAA---------A------   16 
KCND3       11 ---------------------FARAA---------A------   16 
KCNF1        3 ---------------------GSGER---------S------    8 
KCNG1       18 -----------CTSDASFHPAFLPQR---------Q------   33 
KCNG2        1 ------------MEPWP---CSPGGG---------G------   12 
KCNG3        5 ------------------------------------------    4 
KCNG4       19 -----------SHSPWSQLLSSPMET---------P------   34 
KCNV1        3 ---------------------SSGRA---------L------    8 
KCNV2       40 -------------------QASIHGW---------T------   47 
KCNS1        3 ---------------------MLLVR---------G------    8 
KCNS2        3 ---------------------GQSLW---------D------    8 
KCNS3        3 ---------------------FGEFF----------------    7 

cons       127                                             168 


KCNQ1       21 PGARRG------------------------------------   26 
KCNQ2        8 GGVYPG------------------------------------   13 
KCNQ3       15 GGDGGGGGGG-------AA----------------NPAG---   30 
KCNQ4        4 APPRRL------------------------------------    9 
KCNQ5       27 AGGGRL------------------------------------   32 
KCNA1        9 VDEASAAPG---------------HPQ---------------   20 
KCNA2        9 ADEAAALPG---------------HPQ---------------   20 
KCNA3       61 LLEPEVADGG-------GA-----PPQGGC----GGGGCDRY   86 
KCNA4      129 EEEEEEEEEG-------RF-----YYSEDD----HGDEC---  151 
KCNA5       75 VRPLPPLPEE-------LP-----RPRRPP----PEDEE---   97 
KCNA6       25 --------AG-------DF-----PEAGG-------------   33 
KCNA7        5 CP----------------------------------------    6 
KCNA10      60 ETAFSKLPGD-------YA-----DPPGPE----PVVLN---   82 
KCNB1        5 --------M---------------TKH---------------    8 
KCNB2        9 --------L---------------NRK---------------   12 
KCNC1        1 ------------------------------------------    0 
KCNC2        1 ------------------------------------------    0 
KCNC3       39 QQQQPAQPGP-------AA-----SPAGPPAPRGPGDRR---   65 
KCNC4       20 --------P----------------------------S----   21 
KCND1       17 VGWLPLAQQP-------LP-----------------------   28 
KCND2       17 IGWMPVASGP-------MP-----------------------   28 
KCND3       17 IGWMPVANCP-------MP-----------------------   28 
KCNF1        9 ------------------------------------------    8 
KCNG1       34 AI--K-GAF---------------YRR---------------   42 
KCNG2       13 G-----------------------------------------   13 
KCNG3        5 ------------------------------------------    4 
KCNG4       35 SI--K-GLY---------------YRR---------------   43 
KCNV1        9 --------L-----------DSPLDSG---------------   16 
KCNV2       48 EGNYNYYIEEDEDGEEEDQWKDDLAEE---------------   74 
KCNS1        9 --------THYENLRSKVVLPTPLGGR---------------   27 
KCNS2        9 ------------------------------------------    8 
KCNS3        8 ------------------------------------------    7 

cons       169                                             210 


KCNQ1       27 -----S------------------------------------   27 
KCNQ2       14 -------P---SGE-----------K-KLKV-------GFVG   26 
KCNQ3       31 ---GDAAA---AGD-----------E-ERKVGLAPGDVEQVT   54 
KCNQ4       10 ----GLGP---PPG-----------D-APRA-------E-LV   24 
KCNQ5       33 ----GSGM---KDV-----------E-SGRG-------R-VL   47 
KCNA1       21 DG-S------YP-R---------Q-A-D---HDDHECCERVV   40 
KCNA2       21 DT-Y------DP-----------E--------ADHECCERVV   36 
KCNA3       87 EP-L------PP-S---------L-PAA---GEQDCCGERVV  107 
KCNA4      152 SY-T------DL-LPQDEGGGG-Y-S-S---VRYSDCCERVV  179 
KCNA5       98 EE-G------DP-G--LGTVED-Q-A-L---GTASLHHQRVH  123 
KCNA6       34 -------------------------------GGGCCSSERLV   44 
KCNA7        7 --------------------------------PPCGCCERLV   16 
KCNA10      83 -----------------------------------EGNQRVI   89 
KCNB1        9 GS-RSTSSLPPE-P---------M-E-I---VRSKACSRRVR   34 
KCNB2       13 TS-RSTLSLPPE-P---------V-D-I---IRSKTCSRRVK   38 
KCNC1        1 -------------------------------MGQGDESERIV   11 
KCNC2        1 -------------------------------MGKIENNERVI   11 
KCNC3       66 AEPC------PG-L---P-A-AAMGR-H---GGGGGDSGKIV   91 
KCNC4       22 K----------------T----CLKE-E---MAKGEASEKII   39 
KCND1       29 -----------P-A---------P-G-V---KAS-RGDEVLV   43 
KCND2       29 -----------A-P---------P-R-Q---ERKRTQDALIV   44 
KCND3       29 -----------L-A---------P-A-D---KNK-RQDELIV   43 
KCNF1        9 ---------LPE-P---------G-S-Q---SSAASDDIEIV   26 
KCNG1       43 A--Q-RLRPQDE-P---------R-Q-G---CQPEDRRRRII   66 
KCNG2       14 -----------------------------------TRARHVI   20 
KCNG3        5 ----------------------------------RSGAASVV   12 
KCNG4       44 V--R-KVGAL-----------------D---ASPVDLKKEIL   62 
KCNV1       17 SL-TSLDSSVFC-S---------E-G-E---GEPLALGDCFT   42 
KCNV2       75 DQ-QAGEVTTAK-P---------E-G-P---SDPPALLSTLN  100 
KCNS1       28 ST-ETFVSEFPG-P---------D-T-G---IRWRRSDEALR   53 
KCNS2        9 ---------------------------V---SEANVEDGEIR   20 
KCNS3        8 -------------------------------HRPGQDEELVN   18 

cons       211                                             252 


KCNQ1       28 ------------------------------------------   27 
KCNQ2       27 LDP---------------------------------------   29 
KCNQ3       55 LAL---------------------------------------   57 
KCNQ4       25 ALT---------------------------------------   27 
KCNQ5       48 LNS---------------------------------------   50 
KCNA1       41 INI---------------------------------------   43 
KCNA2       37 INI---------------------------------------   39 
KCNA3      108 INI---------------------------------------  110 
KCNA4      180 INV---------------------------------------  182 
KCNA5      124 INI---------------------------------------  126 
KCNA6       45 INI---------------------------------------   47 
KCNA7       17 LNV---------------------------------------   19 
KCNA10      90 INI---------------------------------------   92 
KCNB1       35 LNV---------------------------------------   37 
KCNB2       39 INV---------------------------------------   41 
KCNC1       12 INVGGTRHQTYRSTLRTLPGTRLAWLAEPDAH----------   43 
KCNC2       12 LNVGGTRHETYRSTLKTLPGTRLALLASSEPPGDCLTTAGDK   53 
KCNC3       92 INVGGVRHETYRSTLRTLPGTRLAGLTEPEAA----------  123 
KCNC4       40 INVGGTRHETYRSTLRTLPGTRLAWLADPDGG----------   71 
KCND1       44 VNV---------------------------------------   46 
KCND2       45 LNV---------------------------------------   47 
KCND3       44 LNV---------------------------------------   46 
KCNF1       27 VNV---------------------------------------   29 
KCNG1       67 INV---------------------------------------   69 
KCNG2       21 INV---------------------------------------   23 
KCNG3       13 LNV---------------------------------------   15 
KCNG4       63 INV---------------------------------------   65 
KCNV1       43 VNV---------------------------------------   45 
KCNV2      101 VNV---------------------------------------  103 
KCNS1       54 VNV---------------------------------------   56 
KCNS2       21 INV---------------------------------------   23 
KCNS3       19 LNV---------------------------------------   21 

cons       253                                             294 


KCNQ1       28 ---A--GLAKKCPFSLELAE---------GG---------P-   45 
KCNQ2       30 ---GAPDSTRDGALLIA------------GS---------E-   46 
KCNQ3       58 ---G-AGADKDGTLLLEG-----------GG---------R-   74 
KCNQ4       28 ---AV--QSEQGEAGGG------------GS---------P-   42 
KCNQ5       51 ---AA--ARGDGLLLLGTRAATL------GG---------G-   71 
KCNA1       44 ---SG--LRFETQLKTLAQFPNTLL----GN-PK--------   67 
KCNA2       40 ---SG--LRFETQLKTLAQFPETLL----GD-PK--------   63 
KCNA3      111 ---SG--LRFETQLKTLCQFPETLL----GD-PK--------  134 
KCNA4      183 ---SG--LRFETQMKTLAQFPETLL----GD-PE--------  206 
KCNA5      127 ---SG--LRFETQLGTLAQFPNTLL----GD-PA--------  150 
KCNA6       48 ---SG--LRFETQLRTLSLFPDTLL----GD-PG--------   71 
KCNA7       20 ---AG--LRFETRARTLGRFPDTLL----GD-PA--------   43 
KCNA10      93 ---AG--LRFETQLRTLSQFPETLL----GD-RE--------  116 
KCNB1       38 ---GG--LAHEVLWRTLDRLPRTRL----GK-LRDCNT--HD   67 
KCNB2       42 ---GG--LNHEVLWRTLDRLPRTRL----GK-LRDCNT--HE   71 
KCNC1       44 ----------------------S-------------------   44 
KCNC2       54 LQPSPPPLSPPPRAPPLSPGPGGCFEGGAGNCSS--------   87 
KCNC3      124 ----------------------ARF-----------------  126 
KCNC4       72 ----------------------GRPETDGGGV----------   81 
KCND1       47 ---SG--RRFETWKNTLDRYPDTLL----GS-SE--------   70 
KCND2       48 ---SG--TRFQTWQDTLERYPDTLL----GS-SE--------   71 
KCND3       47 ---SG--RRFQTWRTTLERYPDTLL----GS-TE--------   70 
KCNF1       30 ---GG--VRQVLYGDLLSQYPETRL----AE-LINCLAGGYD   61 
KCNG1       70 ---GG--IKYSLPWTTLDEFPLTRL----GQ-LKACTN--FD   99 
KCNG2       24 ---GG--CRVRLAWAALARCPLARL----ER-LRACRG--HD   53 
KCNG3       16 ---GG--ARYSLSRELLKDFPLRRV----SR-LHGCRS--ER   45 
KCNG4       66 ---GG--RRYLLPWSTLDRFPLSRL----SK-LRLCRS--YE   95 
KCNV1       46 ---GG--SRFVLSQQALSCFPHTRL----GK-LAVVVA--SY   75 
KCNV2      104 ---GG--HSYQLDYCELAGFPKTRL----GR-LATSTS--RS  133 
KCNS1       57 ---GG--VRRQLSARALARFPGTRL----GR-LQAAAS--EE   86 
KCNS2       24 ---GG--FKRRLRSHTLLRFPETRL----GR-LLLCHS--RE   53 
KCNS3       22 ---GG--FKQSVDQSTLLRFPHTRL----GK-LLTCHS--EE   51 

cons       295                                             336 


KCNQ1       46 -----------------------AGGALYAPIAPGAPGP---   61 
KCNQ2       47 ---------------------------------APK------   49 
KCNQ3       75 ------------------------DEGQR-------------   79 
KCNQ4       43 ------------------------------R-RLGL------   47 
KCNQ5       72 ------------------------GGGLRES-RRG-------   81 
KCNA1       68 ----------KR--MR---YFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILY   94 
KCNA2       64 ----------KR--MR---YFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILY   90 
KCNA3      135 ----------RR--MR---YFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILY  161 
KCNA4      207 ----------KR--TQ---YFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILY  233 
KCNA5      151 ----------KR--LR---YFDPLRNEYFFDRNRPSFDGILY  177 
KCNA6       72 ----------RR--VR---FFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILY   98 
KCNA7       44 ----------RR--GR---FYDDARREYFFDRHRPSFDAVLY   70 
KCNA10     117 ----------KR--MQ---FFDSMRNEYFFDRNRPSFDGILY  143 
KCNB1       68 ----------SL--LEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILN   97 
KCNB2       72 ----------SL--LEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILN  101 
KCNC1       45 --------------HF---DYDPRADEFFFDRHPGVFAHILN   69 
KCNC2       88 ----------RGGRAS---DHPGGGREFFFDRHPGVFAYVLN  116 
KCNC3      127 -------------------DYDPGADEFFFDRHPGVFAYVLN  149 
KCNC4       82 ------------GSSG---SSGGGGCEFFFDRHPGVFAYVLN  108 
KCND1       71 ----------KE---F---FYDADSGEYFFDRDPDMFRHVLN   96 
KCND2       72 ----------RD---F---FYHPETQQYFFDRDPDIFRHILN   97 
KCND3       71 ----------KE---F---FFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLN   96 
KCNF1       62 ----------TI--FSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIE   91 
KCNG1      100 ----------DI--LNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILT  129 
KCNG2       54 ----------DL--LRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVA   83 
KCNG3       46 ----------DV--LEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILL   75 
KCNG4       96 ----------EI--VQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVS  125 
KCNV1       76 RRPGALAAVPSP--LELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLH  115 
KCNV2      134 ----------RQ--LSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYN  163 
KCNS1       87 ----------QA--RRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLH  116 
KCNS2       54 ----------AI--LELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLH   83 
KCNS3       52 ----------AI--LELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLN   81 

cons       337                                             378 


KCNQ1       62 -----APPASP-----AAPAAPPVASDL-G--PRP--PVSL-   87 
KCNQ2       50 ----------R-----GSILS--------K--PRA--GGA--   62 
KCNQ3       80 ----------------R-TPQ--------G--IGLLAKT---   91 
KCNQ4       48 ----------LGSPLPPGAPLP-------G--PGS--GSGS-   67 
KCNQ5       82 ---------------KQGARMS-------L--LGK--PL-SY   96 
KCNA1       95 YYQSGGRLRRPV-----NVPLDMFSEEIKFYELGE--EAME-  128 
KCNA2       91 YYQSGGRLRRPV-----NVPLDIFSEEIRFYELGE--EAME-  124 
KCNA3      162 YYQSGGRIRRPV-----NVPIDIFSEEIRFYQLGE--EAME-  195 
KCNA4      234 YYQSGGRLKRPV-----NVPFDIFTEEVKFYQLGE--EALL-  267 
KCNA5      178 YYQSGGRLRRPV-----NVSLDVFADEIRFYQLGD--EAME-  211 
KCNA6       99 YYQSGGRLRRPV-----NVPLDIFLEEIRFYQLGD--EALA-  132 
KCNA7       71 YYQSGGRLRRPA-----HVPLDVFLEEVAFYGLGA--AALA-  104 
KCNA10     144 YYQSGGKIRRPA-----NVPIDIFADEISFYELGS--EAMD-  177 
KCNB1       98 FYRT-GRLHMME-----EMCALSFSQELDYWGIDE--IYLE-  130 
KCNB2      102 FYRT-GKLHMME-----EMCALSFGQELDYWGIDE--IYLE-  134 
KCNC1       70 YYRT-GKLHCPA-----DVCGPLYEEELAFWGIDE--TDVE-  102 
KCNC2      117 YYRT-GKLHCPA-----DVCGPLFEEELAFWGIDE--TDVE-  149 
KCNC3      150 YYRT-GKLHCPA-----DVCGPLFEEELGFWGIDE--TDVE-  182 
KCNC4      109 YYRT-GKLHCPA-----DVCGPLFEEELTFWGIDE--TDVE-  141 
KCND1       97 FYRT-GRLHCPR-----QECIQAFDEELAFYGLVP--ELVG-  129 
KCND2       98 FYRT-GKLHYPR-----HECISAYDEELAFFGLIP--EIIG-  130 
KCND3       97 FYRT-GKLHYPR-----YECISAYDDELAFYGILP--EIIG-  129 
KCNF1       92 VYYF-GEVHMKK-----GICPICFKNEMDFWKVDL--KFLD-  124 
KCNG1      130 FLRA-GKLRLLR-----EMCALSFQEELLYWGIAE--DHLD-  162 
KCNG2       84 LLRA-GKLRLLR-----GPCALAFRDELAYWGIDE--ARLE-  116 
KCNG3       76 YVRGHGKLRFAP-----RMCELSFYNEMIYWGLEG--AHLE-  109 
KCNG4      126 FLAA-GKLVLLQ-----EMCALSFQEELAYWGIEE--AHLE-  158 
KCNV1      116 YYRT-GRLHVME-----QLCALSFLQEIQYWGIDE--LSID-  148 
KCNV2      164 FYLS-GVLLVLD-----GLCPRRFLEELGYWGVRL--KYTP-  196 
KCNS1      117 FYRT-GHLHVLD-----ELCVFAFGQEADYWGLGE--NALA-  149 
KCNS2       84 FYHT-GKLHVMA-----ELCVFSFSQEIEYWGINE--FFID-  116 
KCNS3       82 FYYT-GKLHVME-----ELCVFSFCQEIEYWGINE--LFID-  114 

cons       379                                             420 


KCNQ1       88 -----DPRVSIYSTRRPVLARTH-------------------  105 
KCNQ2       63 GAGK-PPKRNAFYRK---------------------------   76 
KCNQ3       92 PLSRPVKRNNAKYRR---------------------------  106 
KCNQ4       68 ACGQRSSAAHKRYRR---------------------------   82 
KCNQ5       97 TSSQ-SCRRNVKYRR---------------------------  110 
KCNA1      129 ---K--FREDEGF-----------------------------  136 
KCNA2      125 ---M--FREDEGY-----------------------------  132 
KCNA3      196 ---K--FREDEGF-----------------------------  203 
KCNA4      268 ---K--FREDEGF-----------------------------  275 
KCNA5      212 ---R--FREDEGF-----------------------------  219 
KCNA6      133 ---A--FREDEGC-----------------------------  140 
KCNA7      105 ---R--LREDEGC-----------------------------  112 
KCNA10     178 ---Q--FREDEGF-----------------------------  185 
KCNB1      131 ---S--CCQARYHQKKEQMNEELKREAE-T------------  154 
KCNB2      135 ---S--CCQARYHQKKEQMNEELRREAE-T------------  158 
KCNC1      103 ---P--CCWMTYRQHRDAEEALDSFGGAP-LDNSADDADADG  138 
KCNC2      150 ---P--CCWMTYRQHRDAEEALDIFETPD-LI----------  175 
KCNC3      183 ---A--CCWMTYRQHRDAEEALDSFEAPD-PAGAANAANAAG  218 
KCNC4      142 ---P--CCWMTYRQHRDAEEALDIFESPD-G-----GGSGAG  172 
KCND1      130 ---D--CCLEEYRDRKKENAERLAEDEEA-E-----------  154 
KCND2      131 ---D--CCYEEYKDRRRENAERLQDDADT-D-----------  155 
KCND3      130 ---D--CCYEEYKDRKRENAERLMDDNDS-E-----------  154 
KCNF1      125 ---D--CCKSHLSEKREELEEIARRVQL--------------  147 
KCNG1      163 ---G--CCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDA-----------  188 
KCNG2      117 ---R--CCLRRLRRREEEAAEARAGPTER-------------  140 
KCNG3      110 ---Y--CCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPG-------------  133 
KCNG4      159 ---R--CCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVL-----------  184 
KCNV1      149 ---S--CCRDRYFRRKE-LSETLDFKKD-T------------  171 
KCNV2      197 ---R--CCRICFEERRDELSERLKIQHE--------------  219 
KCNS1      150 ---A--CCRARYLERRLTQ-PHAWDEDSDTP------SSVD-  178 
KCNS2      117 ---S--CCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQE-------STT-  145 
KCNS3      115 ---S--CCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDV-------STD-  143 

cons       421                                             462 


KCNQ1      106 ------------------------------------------  105 
KCNQ2       77 ------------------------------------------   76 
KCNQ3      107 ------------------------------------------  106 
KCNQ4       83 ------------------------------------------   82 
KCNQ5      111 ------------------------------------------  110 
KCNA1      137 ----------I---K---EE-E-R-----PL-----------  144 
KCNA2      133 ----------I---K---EE-E-R-----PL-----------  140 
KCNA3      204 ----------L---R---EE-E-R-----PL-----------  211 
KCNA4      276 ----------V---RE--EE-D-R-----AL-----------  284 
KCNA5      220 ----------I---K---EE-E-K-----PL-----------  227 
KCNA6      141 ----------L---PEGGED-E-K-----PL-----------  151 
KCNA7      113 ----------P---V---PP-E-R-----PL-----------  120 
KCNA10     186 ----------I---K---DP-E-T-----LL-----------  193 
KCNB1      155 ----------------LRER-E-G-----EE-----------  162 
KCNB2      159 ----------------MRER-E-G-----EE-----------  166 
KCNC1      139 PGDS-GDG-----------EDE-L----EMTKRLALSDS---  160 
KCNC2      176 GGDP-GDD------------ED-L-----AAKRLGIEDAAG-  197 
KCNC3      219 AHDGGLDDEAG---A---GGGG-LDGAGGELKRLCFQDAGGG  253 
KCNC4      173 PSDEAGDD-----------ERE-L-----ALQRLGPHEGG--  195 
KCND1      155 --------------Q---AG-DGP-----AL-----------  162 
KCND2      156 --------------T---AG-ES------AL-----------  162 
KCND3      155 --------------N---NQ--E------SM-----------  160 
KCNF1      148 ----------------ILDD-L-G-----VD-----------  155 
KCNG1      189 ----------LDSEG-RDSE-G-------PA-----------  200 
KCNG2      141 ------------GAQ-GSPA-R-------AL-----------  150 
KCNG3      134 ------------VLG-RDEA-R-------PG-----------  143 
KCNG4      185 ------------RQQ-RETR-R-------PA-----------  194 
KCNV1      172 ----------EDQES-QHES---E-----QD-----------  183 
KCNV2      220 -------L--RAQA--QVEE-A-E-----EL-----------  232 
KCNS1      179 ---PC-PD--E-IS--DVQR-E-L-----AR-----------  193 
KCNS2      146 ---SS-FD--E-IL--AFYN-D-A-----SK-----------  160 
KCNS3      144 ---SS-FE--E-SS--LFEK-E-L-----EK-----------  158 

cons       463                                             504 


KCNQ1      106 --------------------VQGRVYNFLERPT-GWKCFVYH  126 
KCNQ2       77 --------------------LQNFLYNVLERPR-G-WAFIYH   96 
KCNQ3      107 --------------------IQTLIYDALERPR-G-WALLYH  126 
KCNQ4       83 --------------------LQNWVYNVLERPR-G-WAFVYH  102 
KCNQ5      111 --------------------VQNYLYNVLERPR-G-WAFIYH  130 
KCNA1      145 --------------P-EK-EYQRQVWLLFEYPESSGPARVIA  170 
KCNA2      141 --------------P-EN-EFQRQVWLLFEYPESSGPARIIA  166 
KCNA3      212 --------------P-RR-DFQRQVWLLFEYPESSGPARGIA  237 
KCNA4      285 --------------P-EN-EFKKQIWLLFEYPESSSPARGIA  310 
KCNA5      228 --------------P-RN-EFQRQVWLIFEYPESSGSARAIA  253 
KCNA6      152 --------------P-SQ-PFQRQVWLLFEYPESSGPARGIA  177 
KCNA7      121 --------------P-RR-AFARQLWLLFEFPESSQAARVLA  146 
KCNA10     194 --------------P-TN-DIHRQFWLLFEYPESSSAARAVA  219 
KCNB1      163 -----F----DNT-C-CA-EKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILA  192 
KCNB2      167 -----F----DNT-C-CP-DKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILA  196 
KCNC1      161 ---PDG----RPGGF-WR-RWQPRIWALFEDPYSSRYARYVA  193 
KCNC2      198 LGGPDG----KSGR--WR-RLQPRMWALFEDPYSSRAARFIA  232 
KCNC3      254 AGGPPGGAGGAGGTW-WR-RWQPRVWALFEDPYSSRAARYVA  293 
KCNC4      196 -AGHGA----GSGG--CR-GWQPRMWALFEDPYSSRAARVVA  229 
KCND1      163 --------------PAGS-SLRQRLWRAFENPHTSTAALVFY  189 
KCND2      163 --------------PTMT--ARQRVWRAFENPHTSTMALVFY  188 
KCND3      161 --------------PSLS--FRQTMWRAFENPHTSTLALVFY  186 
KCNF1      156 -----A----AEG-R-WR-RCQKCVWKFLEKPESSCPARVVA  185 
KCNG1      201 -----E----GEGRL-GR--CMRRLRDMVERPHSGLPGKVFA  230 
KCNG2      151 -----G----PRGRL-QR--GRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFA  180 
KCNG3      144 -----G----AEAAP-SR-RWLERMRRTFEEPTSSLAAQILA  174 
KCNG4      195 -----S----HSSRW-GL--CMNRLREMVENPQSGLPGKVFA  224 
KCNV1      184 -----F----SQG-P-CP-TVRQKLWNILEKPGSSTAARIFG  213 
KCNV2      233 -----F----RDM-R-FYGPQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIG  263 
KCNS1      194 -----Y----GAA-R-CG-RLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFS  223 
KCNS2      161 -----F----DGQ-P-LG-NFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFS  190 
KCNS3      159 -----F----DTL-R-FG-QLRKKIWIRMENPAYCLSAKLIA  188 

cons       505                         .   .: *            546 


KCNQ1      127 FAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYA-------------------  149 
KCNQ2       97 AYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYE-------------------  119 
KCNQ3      127 ALVFLIVLGCLILAVLTTFKEYE-------------------  149 
KCNQ4      103 VFIFLLVFSCLVLSVLSTIQEHQ-------------------  125 
KCNQ5      131 AFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHT-------------------  153 
KCNA1      171 IVSVMVILISIVIFCLETLPELKDDK-DF--------TG---  200 
KCNA2      167 IVSVMVILISIVSFCLETLPIFRDEN-ED--------MHGSG  199 
KCNA3      238 IVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEK-DY--------PA-ST  269 
KCNA4      311 IVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDR-DL--------VM-AL  342 
KCNA5      254 IVSVLVILISIITFCLETLPEFRDER-ELLRHPPAP------  288 
KCNA6      178 IVSVLVILISIVIFCLETLPQFRVDG-RGGNNGGVSRVS-PV  217 
KCNA7      147 VVSVLVILVSIVVFCLETLPDFRDDR-DGTGL-----AA-AA  181 
KCNA10     220 VVSVLVVVISITIFCLETLPEFREDR-EL--------KV---  249 
KCNB1      193 IISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLD-EF--------GQ---  222 
KCNB2      197 IVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETD-EF--------GQ---  226 
KCNC1      194 FASLFFILVSITTFCLETHERFNPIV-NK--------TE-I-  224 
KCNC2      233 FASLFFILVSITTFCLETHEAFNI---VK--------NK-T-  261 
KCNC3      294 FASLFFILISITTFCLETHEGFIHIS-NK--------TV-T-  324 
KCNC4      230 FASLFFILVSITTFCLETHEAFNI---DR-NV-----TE-I-  260 
KCND1      190 YVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSAR-RS--------SR---  219 
KCND2      189 YVTGFFIAVSVIANVVETVPCGS-SP-GH--------IK---  217 
KCND3      187 YVTGFFIAVSVITNVVETVPCGT-VP-G---------SK---  214 
KCNF1      186 VLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLD-AE--------GN---  215 
KCNG1      231 CLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEE-Q--------GH---  260 
KCNG2      181 CVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEE-R--------GE---  210 
KCNG3      175 SVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWR-NAAAD--------NR---  204 
KCNG4      225 CLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEED-Q--------GE---  254 
KCNV1      214 VISIIFVVVSIINMALMSAELS--------------------  235 
KCNV2      264 VASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHS-GQ--------GE---  293 
KCNS1      224 CVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQARE-AA--------AA---  253 
KCNS2      191 ILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPD-SQ--------GN---  220 
KCNS3      189 ISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNED-GE-------------  216 

cons       547      .:          :                          588 


KCNQ1      150 ---------------------------------------ALA  152 
KCNQ2      120 ---------------------------------------KSS  122 
KCNQ3      150 ---------------------------------------TVS  152 
KCNQ4      126 ---------------------------------------ELA  128 
KCNQ5      154 ---------------------------------------KLA  156 
KCNA1      201 --------------TV-HRI----D------NTTVIYNSNIF  217 
KCNA2      200 ---V----------TF-HTY----S-----NSTIGYQQSTSF  218 
KCNA3      270 ---SQD--------SF-EAAG---N-----STSGSRAGASSF  291 
KCNA4      343 ---SAG--------GH-GGLLNDTS-----APHLENSGHTIF  367 
KCNA5      289 ---HQPPAPAPGAN--GSGVMAPPS-----GPTVAPLLPRTL  320 
KCNA6      218 SRGSQEEEEDEDDSYTFHHGITPGEMGTGGSSSLSTLGGSFF  259 
KCNA7      182 ---AAG--------PF-PAPL-NGS-----SQMPGNPPRLPF  205 
KCNA10     250 --------------VR-DPN----L-----NMSKTVLSQTMF  267 
KCNB1      223 ----------------------------------------ST  224 
KCNB2      227 ----------------------------------------LN  228 
KCNC1      225 ---E-------------NV-----R-----NGTQVRYYREAE  240 
KCNC2      262 ---E-------------PV-----I-----NGTSVVLQYEIE  277 
KCNC3      325 ---QA---------SP-IP-----G-----APPENITNVEVE  343 
KCNC4      261 ---L-------------RV-----G-----NITSVHFRREVE  276 
KCND1      220 ----------------------------------EQPCGERF  227 
KCND2      218 ----------------------------------ELPCGERY  225 
KCND3      215 ----------------------------------ELPCGERY  222 
KCNF1      216 ----------------------------------------RV  217 
KCNG1      261 ------------------C--------------------SQM  264 
KCNG2      211 ------------------C--------------------SPK  214 
KCNG3      205 ------------------S-L----------DDRSRYSAGPG  217 
KCNG4      255 ------------------C--------------------SRK  258 
KCNV1      236 ----------------------------------------WL  237 
KCNV2      294 ------------------G--------------------GPD  297 
KCNS1      254 ------------------VA----------AVAAGRSPEGVR  267 
KCNS2      221 ----------------------------------------PG  222 
KCNS3      217 -----------------------------------------V  217 

cons       589                                             630 


KCNQ1      153 TGT-LF-WMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCRSKYVGLWGRLR  192 
KCNQ2      123 EGA-LY-ILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLK  162 
KCNQ3      153 GDW-LL-LLETFAIFIFGAEFALRIWAAGCCCRYKGWRGRLK  192 
KCNQ4      129 NEC-LL-ILEFVMIVVFGLEYIVRVWSAGCCCRYRGWQGRFR  168 
KCNQ5      157 SSC-LL-ILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCCCRYRGWQGRLR  196 
KCNA1      218 TDP-FF-IVETLCIIWFSFELVVR---------FFACPSKTD  248 
KCNA2      219 TDP-FF-IVETLCIIWFSFEFLVR---------FFACPSKAG  249 
KCNA3      292 SDP-FF-VVETLCIIWFSFELLVR---------FFACPSKAT  322 
KCNA4      368 NDP-FF-IVETVCIVWFSFEFVVR---------CFACPSQAL  398 
KCNA5      321 ADP-FF-IVETTCVIWFTFELLVR---------FFACPSKAG  351 
KCNA6      260 TDP-FF-LVETLCIVWFTFELLVR---------FSACPSKPA  290 
KCNA7      206 NDP-FF-VVETLCICWFSFELLVR---------LLVCPSKAI  236 
KCNA10     268 TDP-FF-MVESTCIVWFTFELVLR---------FVVCPSKTD  298 
KCNB1      225 DNPQLA-HVEAVCIAWFTMEYLLR---------FLSSPKKWK  256 
KCNB2      229 DNRQLA-HVEAVCIAWFTMEYLLR---------FLSSPNKWK  260 
KCNC1      241 TEA-FLTYIEGVCVVWFTFEFLMR---------VIFCPNKVE  272 
KCNC2      278 TDP-ALTYVEGVCVVWFTFEFLVR---------IVFSPNKLE  309 
KCNC3      344 TEP-FLTYVEGVCVVWFTFEFLMR---------ITFCPDKVE  375 
KCNC4      277 TEP-ILTYIEGVCVLWFTLEFLVR---------IVCCPDTLD  308 
KCND1      228 PQA-FF-CMDTACVLIFTGEYLLR---------LFAAPSRCR  258 
KCND2      226 AVA-FF-CLDTACVMIFTVEYLLR---------LAAAPSRYR  256 
KCND3      223 SVA-FF-CLDTACVMIFTVEYLLR---------LFAAPSRYR  253 
KCNF1      218 EHPTLE-NVETACIGWFTLEYLLR---------LFSSPNKLH  249 
KCNG1      265 CHN-VF-IVESVCVGWFSLEFLLR---------LIQAPSKFA  295 
KCNG2      215 CRS-LF-VLETVCVAWFSFEFLLR---------SLQAESKCA  245 
KCNG3      218 REP-SG-IIEAICIGWFTAECIVR---------FIVSKNKCE  248 
KCNG4      259 CYY-IF-IVETICVAWFSLEFCLR---------FVQAQDKCQ  289 
KCNV1      238 DLQLLE-ILEYVCISWFTGEFVLR---------FLCVRDRCR  269 
KCNV2      298 LRPILE-HVEMLCMGFFTLEYLLR---------LASTPDLRR  329 
KCNS1      268 DDPVLR-RLEYFCIAWFSFEVSSR---------LLLAPSTRN  299 
KCNS2      223 EDPRFE-IVEHFGIAWFTFELVAR---------FAVAPDFLK  254 
KCNS3      218 DDPVLE-GVEIACIAWFTGELAVR---------LAAAPCQKK  249 

cons       631         ::   :  *  *   *                    672 


KCNQ1      193 FARKPISIIDLIVVVASMVVLCVG----------------SK  218 
KCNQ2      163 FARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAG----------------SQ  188 
KCNQ3      193 FARKPLCMLDIFVLIASVPVVAVG----------------NQ  218 
KCNQ4      169 FARKPFCVIDFIVFVASVAVIAAG----------------TQ  194 
KCNQ5      197 FARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAK----------------TQ  222 
KCNA1      249 FFKNIMNFIDIVAIIPYFITLGTEIAEQEG-------N-QKG  282 
KCNA2      250 FFTNIMNIIDIVAIIPYFITLGTELAEKPE-------DAQQG  284 
KCNA3      323 FSRNIMNLIDIVAIIPYFITLGTELAERQ----------GNG  354 
KCNA4      399 FFKNIMNIIDIVSILPYFITLGTDLAQQQGG------GNGQQ  434 
KCNA5      352 FSRNIMNIIDVVAIFPYFITLGTELAEQQ---PGGGGGGQNG  390 
KCNA6      291 FFRNIMNIIDLVAIFPYFITLGTELVQQQEQQPASGGGGQNG  332 
KCNA7      237 FFKNVMNLIDFVAILPYFVALGTELARQR----------GVG  268 
KCNA10     299 FFRNIMNIIDIISIIPYFATLITELVQETEP---------SA  331 
KCNB1      257 FFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTES---N--------KSVL  287 
KCNB2      261 FFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTES---N--------KSVL  291 
KCNC1      273 FIKNSLNIIDFVAILPFYLEVGLSG-------------LSSK  301 
KCNC2      310 FIKNLLNIIDFVAILPFYLEVGLSG-------------LSSK  338 
KCNC3      376 FLKSSLNIIDCVAILPFYLEVGLSG-------------LSSK  404 
KCNC4      309 FVKNLLNIIDFVAILPFYLEVGLSG-------------LSSK  337 
KCND1      259 FLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPK-----------------  283 
KCND2      257 FVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTD-----------------  281 
KCND3      254 FIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTN-----------------  278 
KCNF1      250 FALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL-----------GARMM  280 
KCNG1      296 FLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAAGRR----KPGAGNS  333 
KCNG2      246 FLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGL-----A----AGPGGTK  278 
KCNG3      249 FVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTV-----------FTGENS  279 
KCNG4      290 FFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPEDG----ERPSGSS  327 
KCNV1      270 FLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSG-S--------QTTQ  302 
KCNV2      330 FARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGH----QRGQTVG  367 
KCNS1      300 FFCHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALG-D--------QGGK  332 
KCNS2      255 FFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLV---V--------ESTP  285 
KCNS3      250 FWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTK---E--------EESE  280 

cons       673 *       :* . . .    :                       714 


KCNQ1      219 GQVFATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGGTWRLLGSVVFIHRQ  260 
KCNQ2      189 GNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSK  230 
KCNQ3      219 GNVLA-TSLRSLRFLQILRMLRMDRRGGTWKLLGSAICAHSK  259 
KCNQ4      195 GNIFATSALRSMRFLQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSK  236 
KCNQ5      223 GNIFATSALRSLRFLQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSK  264 
KCNA1      283 EQATSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMR  324 
KCNA2      285 QQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMR  326 
KCNA3      355 QQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMR  396 
KCNA4      435 QQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASMR  476 
KCNA5      391 QQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGKTLQASMR  432 
KCNA6      333 QQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGKTLQASMR  374 
KCNA7      269 QQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLRASMR  310 
KCNA10     332 QQNMSLAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMR  373 
KCNB1      288 QFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYN  329 
KCNB2      292 QFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYN  333 
KCNC1      302 AAKDVLGFLRVVRFVRILRIFKLTRHFVGLRVLGHTLRASTN  343 
KCNC2      339 AAKDVLGFLRVVRFVRILRIFKLTRHFVGLRVLGHTLRASTN  380 
KCNC3      405 AAKDVLGFLRVVRFVRILRIFKLTRHFVGLRVLGHTLRASTN  446 
KCNC4      338 AARDVLGFLRVVRFVRILRIFKLTRHFVGLRVLGHTLRASTN  379 
KCND1      284 -NDDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCAS  324 
KCND2      282 -NEDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCAS  322 
KCND3      279 -NEDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCAS  319 
KCNF1      281 ELTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFK  322 
KCNG1      334 YLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTR  375 
KCNG2      279 LLERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAR  320 
KCNG3      280 QLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYR  321 
KCNG4      328 YLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTR  369 
KCNV1      303 ELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYE  344 
KCNV2      368 SVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQ  409 
KCNS1      333 EFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYR  374 
KCNS2      286 TLANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYK  327 
KCNS3      281 DIENMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYH  322 

cons       715            .* .:   :.:. *:    : :  .        756 


KCNQ1      261 ELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVN-----ESGRVEFG  297 
KCNQ2      231 ELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEKGE----------NDHFD  262 
KCNQ3      260 ELITAWYIGFLTLILSSFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEFE  301 
KCNQ4      237 ELITAWYIGFLVLIFASFLVYLAEKDA----------NSDFS  268 
KCNQ5      265 ELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDA----------NKEFS  296 
KCNA1      325 ELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAEE---------AESHFS  357 
KCNA2      327 ELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADE---------RESQFP  359 
KCNA3      397 ELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADD---------PTSGFS  429 
KCNA4      477 ELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADE---------PTTHFQ  509 
KCNA5      433 ELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADN---------QGTHFS  465 
KCNA6      375 ELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADD---------DDSLFP  407 
KCNA7      311 ELGLLIFFLFIGVVLFSSAVYFAEVDR---------VDSHFT  343 
KCNA10     374 ELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEVDE---------PESHFS  406 
KCNB1      330 ELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE---------DDTKFK  362 
KCNB2      334 ELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE---------DATKFT  366 
KCNC1      344 EFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGAQPNDPSASEHTHFK  385 
KCNC2      381 EFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERVGAQPNDPSASEHTQFK  422 
KCNC3      447 EFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGADPDDILGSNHTYFK  488 
KCNC4      380 EFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGARPSDPRGNDHTDFK  421 
KCND1      325 ELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGT---------NKTNFT  357 
KCND2      323 ELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGS---------SASKFT  355 
KCND3      320 ELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGS---------SASKFT  352 
KCNF1      323 ELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSH---------PETLFK  355 
KCNG1      376 EFGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEM-----A---DSPEFT  409 
KCNG2      321 EFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAEREL-----G---ARRDFS  354 
KCNG3      322 EMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGL-----DLETSNKDFT  358 
KCNG4      370 EFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKES-----G---RVLEFT  403 
KCNV1      345 EVGLLLLFLSVGISIFSTVEYFAEQSI---------PDTTFT  377 
KCNV2      410 QVGCLLLFIAMGIFTFSAAVYSVEHDV---------PSTNFT  442 
KCNS1      375 EVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEE----------DVGFN  406 
KCNS2      328 EVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEE----------NEGLA  359 
KCNS3      323 EVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDD---------HTSSLT  355 

cons       757 :.        : :   :      *                :   798 


KCNQ1      298 SYADALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISF  339 
KCNQ2      263 TYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSF  304 
KCNQ3      302 TYADALWWGLITLATIGYGDKTPKTWEGRLIAATFSLIGVSF  343 
KCNQ4      269 SYADSLWWGTITLTTIGYGDKTPHTWLGRVLAAGFALLGISF  310 
KCNQ5      297 TYADALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISF  338 
KCNA1      358 SIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMYPVTIGGKIVGSLCAIAGVLT  399 
KCNA2      360 SIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMVPTTIGGKIVGSLCAIAGVLT  401 
KCNA3      430 SIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPVTIGGKIVGSLCAIAGVLT  471 
KCNA4      510 SIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITVGGKIVGSLCAIAGVLT  551 
KCNA5      466 SIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMRPITVGGKIVGSLCAIAGVLT  507 
KCNA6      408 SIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMYPMTVGGKIVGSLCAIAGVLT  449 
KCNA7      344 SIPESFWWAVVTMTTVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLT  385 
KCNA10     407 SIPDGFWWAVVTMTTVGYGDMCPTTPGGKIVGTLCAIAGVLT  448 
KCNB1      363 SIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLV  404 
KCNB2      367 SIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLV  408 
KCNC1      386 NIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPQTWSGMLVGALCALAGVLT  427 
KCNC2      423 NIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPQTWSGMLVGALCALAGVLT  464 
KCNC3      489 NIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPKTWSGMLVGALCALAGVLT  530 
KCNC4      422 NIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPKTWSGMLVGALCALAGVLT  463 
KCND1      358 SIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVLV  399 
KCND2      356 SIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLV  397 
KCND3      353 SIPASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLV  394 
KCNF1      356 SIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIA  397 
KCNG1      410 SIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGILL  451 
KCNG2      355 SVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILL  396 
KCNG3      359 SIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVL  400 
KCNG4      404 SIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPRSVPGQMVALSSILSGILI  445 
KCNV1      378 SVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILV  419 
KCNV2      443 TIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAFGIIL  484 
KCNS1      407 TIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILV  448 
KCNS2      360 TIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILV  401 
KCNS3      356 SIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILV  397 

cons       799 . .   *:   :::*:****  * :  *   .      .:    840 


KCNQ1      340 FALPAGILGSGFALKVQQKQRQKHFNRQIPA--AAS-LI-QT  377 
KCNQ2      305 FALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNP--AAG-LI-QS  342 
KCNQ3      344 FALPAGILGSGLALKVQEQHRQKHFEKRRKP--AAE-LI-QA  381 
KCNQ4      311 FALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRMP--AAN-LI-QA  348 
KCNQ5      339 FALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNP--AAN-LI-QC  376 
KCNA1      400 IALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQLLH-----V-S--SP  433 
KCNA2      402 IALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQYLQ-----V-T--SC  435 
KCNA3      472 IALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQSQYMH-----V-G--SC  505 
KCNA4      552 IALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQ-----N-A-VSC  586 
KCNA5      508 IALPVPVIVSNFNYFYHRETDHEEPAVLKEE--QGTQS--QG  545 
KCNA6      450 IALPVPVIVSNFNYFYHRETEQEEQGQYTHV------T----  481 
KCNA7      386 ISLPVPVIVSNFSYFYHRETEGEEAGMFSHV------D----  417 
KCNA10     449 IALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEKQNIPGEIERI-------  483 
KCNB1      405 IALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREA--LER-AK--R  441 
KCNB2      409 IALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREA--LER-AK--R  445 
KCNC1      428 IAMPVPVIVNNFGMYYSLAMAKQKLPKKKKK--HIP-R--PP  464 
KCNC2      465 IAMPVPVIVNNFGMYYSLAMAKQKLPRKRKK--HIP-P--AP  501 
KCNC3      531 IAMPVPVIVNNFGMYYSLAMAKQKLPKKKNK--HIP-R--PP  567 
KCNC4      464 IAMPVPVIVNNFGMYYSLAMAKQKLPKKRKK--HVP-R--PA  500 
KCND1      400 IALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQQKV--RLA-RIRLA  438 
KCND2      398 IALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKA--RLA-RIRAA  436 
KCND3      395 IALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKA--RLA-RIRVA  433 
KCNF1      398 IALPIHPIINNFVRYYNKQRVLETAAKHELE--LME-LN---  433 
KCNG1      452 MAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRA--QFL-I--KT  488 
KCNG2      397 MAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEP--ALQ-E--DS  433 
KCNG3      401 LALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSR--------------  428 
KCNG4      446 MAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLR--HLQ-N--TG  482 
KCNV1      420 LALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREA--LKK-LT--K  456 
KCNV2      485 NGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRER--GEV-NF---  520 
KCNS1      449 VALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNH--QEF-ED---  484 
KCNS2      402 VVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDF--GDG-MK---  437 
KCNS3      398 VALPITIIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDA--PEK-CH---  433 

cons       841   :*   :   :          .                     882 


KCNQ1      378 AWRCY---A-AENPD-----SSTWKIYI--------------  396 
KCNQ2      343 AWRFY---A-TNLSRTD--LHSTWQYYE--------------  364 
KCNQ3      382 AWRYY---A-TNPNRID--LVATWRFYE--------------  403 
KCNQ4      349 AWRLY---S-TDMSRAY--LTATWYYYD--------------  370 
KCNQ5      377 VWRSY---A-ADE-KSV--SIATWK-----------------  394 
KCNA1      434 -NLAS---D-S--D------L---------------------  441 
KCNA2      436 PKIPS---S-P-DL------K---------------------  445 
KCNA3      506 QHLSS-S-A-E-EL------R---------------------  516 
KCNA4      587 PYLPS-N-LLK-KF------R---------------------  598 
KCNA5      546 PGLDR-G-V-Q-RK------V---------------------  556 
KCNA6      482 ----C-G-----------------------------------  483 
KCNA7      418 ----M-Q-P-C-GP------L---------------------  424 
KCNA10     484 ------------------------------------------  483 
KCNB1      442 NG---SIVS-M--N----------------------------  449 
KCNB2      446 NG---SIVS-M--N----------------------------  453 
KCNC1      465 QLGSP---N-Y-CKS-----VVNSPHHS--------------  482 
KCNC2      502 QASSP---T-F-CKT-----ELNMACNS--------------  519 
KCNC3      568 QPGSP---N-Y-CKPDPPPPPPPHPHHGSGGISPPPPITPPS  604 
KCNC4      501 QLESP---M-Y-CKS-----EETSPRDS--------------  518 
KCND1      439 KSGTT---N-A-FLQYK--QNGGLEDSG--S-GEEQALCVRN  470 
KCND2      437 KSGSA---N-A-YMQSK--RNGLLSNQLQ-SSEDEQAFVSKS  470 
KCND3      434 KTGSS---N-A-YLHSK--RNGLLNEALELTGTPEEEHMGKT  468 
KCNF1      434 -----SSSG-G--E----------------------------  439 
KCNG1      489 KSQLS---V-----------S---------------------  495 
KCNG2      434 THSAT---A-----------T---------------------  440 
KCNG3      429 -SLST---E-----------F---------------------  434 
KCNG4      483 PASEC---E-L-LDP-----H---------------------  493 
KCNV1      457 NIATDSYIS-V--N----------------------------  467 
KCNV2      521 -----MQRA-R--K--------K-------------------  527 
KCNS1      485 -----LLSS-I--D--------G-------------------  491 
KCNS2      438 -----EVPS-V--N----------------------------  443 
KCNS3      434 -----ELPY-F--N----------------------------  439 

cons       883                                             924 


KCNQ1      397 ------------------------------------R-KA--  399 
KCNQ2      365 ------------------------------------R-TV--  367 
KCNQ3      404 ------------------------------------S-VV--  406 
KCNQ4      371 ------------------------------------S-IL--  373 
KCNQ5      395 ------------------------------------------  394 
KCNA1      442 ------------------------------------S-R---  443 
KCNA2      446 ------------------------------------K-S---  447 
KCNA3      517 ------------------------------------K-A---  518 
KCNA4      599 ------------------------------------S-S---  600 
KCNA5      557 ------------------------------------S-G---  558 
KCNA6      484 ------------------------------------------  483 
KCNA7      425 ------------------------------------E-G---  426 
KCNA10     484 ------------------------------------L-N---  485 
KCNB1      450 -----------M------------------------K-D---  452 
KCNB2      454 -----------L------------------------K-D---  456 
KCNC1      483 ------------------------------------T-Q---  484 
KCNC2      520 ------------------------------------T-Q---  521 
KCNC3      605 MGVTVAGAYPAGPHTHPGLLRGGAGGLGIMGLPPLPA-P---  642 
KCNC4      519 ------------------------------------T-C---  520 
KCND1      471 RSAFEQQHHHLL------------------------H-CLEK  487 
KCND2      471 GSSFETQHHHLL------------------------H-CLEK  487 
KCND3      469 TSLIESQHHHLL------------------------H-CLEK  485 
KCNF1      440 -----------G------------------------KTG---  443 
KCNG1      496 ------------------------------------------  495 
KCNG2      441 ------------------------------------------  440 
KCNG3      435 ------------------------------------------  434 
KCNG4      494 ------------------------------------------  493 
KCNV1      468 -----------L------------------------R-D---  470 
KCNV2      528 -----------I------------------------A-E---  530 
KCNS1      492 -----------V------------------------S-E---  494 
KCNS2      444 -----------L------------------------R-D---  446 
KCNS3      440 -----------I------------------------R-D---  442 

cons       925                                             966 


KCNQ1      400 -----------------PRSH---------------------  403 
KCNQ2      368 ---------------TVPMYS--SQT------QT--------  378 
KCNQ3      407 ---------------SFPFFR---------------------  412 
KCNQ4      374 -----------------PSFRELALL------FE--------  384 
KCNQ5      395 -----------------PHLK---------------------  398 
KCNA1      444 ---------------RS-----SS-T------MS--------  450 
KCNA2      448 ---------------RS-----AS-T------IS--------  454 
KCNA3      519 ---------------RS-----NS-T------LS--------  525 
KCNA4      601 ---------------TS-----SS-L------GD--------  607 
KCNA5      559 ---------------SR-----GS-F------CK--------  565 
KCNA6      484 ------------------------------------------  483 
KCNA7      427 ---------------KA-----NG-G------LV--------  433 
KCNA10     486 ---------------SV-----GS-R------MG--------  492 
KCNB1      453 ---------------AF-----AR-S------IE-----MMD  462 
KCNB2      457 ---------------AF-----AR-S------ME-----LID  466 
KCNC1      485 ---------------SD-----TC-P------LA--------  491 
KCNC2      522 ---------------SD-----TC-L------GK--------  528 
KCNC3      643 ---------------GE-----PC-P------LA--------  649 
KCNC4      521 ---------------SD-----TSPP------AR--------  528 
KCND1      488 TT--------------------------CHEFTD--------  495 
KCND2      488 TT--------------------------NHEFVD--------  495 
KCND3      486 TTGLSYLVDDPLLSVRT-----S--TIKNHEFID--------  512 
KCNF1      444 ---------------GS-----RS-D------LD-----NLP  453 
KCNG1      496 ---------------QD-----SD-I------LFGSAS--SD  508 
KCNG2      441 ---------------ED-----SS-Q------GPDSAGLADD  455 
KCNG3      435 ---------------L--------------------------  435 
KCNG4      494 ---------------VA-----SE-H------EL-----MND  503 
KCNV1      471 ---------------VY-----AR-S------IM-----EML  480 
KCNV2      531 ---------------CL-----LG-S------NP-----QLT  540 
KCNS1      495 ---------------AS-----LE-T------SR-----ETS  504 
KCNS2      447 ---------------YY-----AH-K------VK-----SLM  456 
KCNS3      443 ---------------IY-----AQ-R------MH-----TFI  452 

cons       967                                            1008 


KCNQ1      404 ------------------------------------------  403 
KCNQ2      379 Y-GAS----------------RLIPPLNQLELLRNLKSKSGL  403 
KCNQ3      413 ------------------------------------------  412 
KCNQ4      385 H-VQR----------------ARNGGLRPLEVRRAPVPDGAP  409 
KCNQ5      399 ----------------------------A-------------  399 
KCNA1      451 --KSE-------------Y--MEI------------------  457 
KCNA2      455 --KSD-------------Y--MEI------------------  461 
KCNA3      526 --KSE-------------Y--MVI------------------  532 
KCNA4      608 --KSE-------------Y--LEM------------------  614 
KCNA5      566 --AGGTLENADSARRGSCP--LEK------------------  585 
KCNA6      484 ---QPAPDLRAT-DNGLGK--PDF------------------  501 
KCNA7      434 ------------------D--GEV------------------  437 
KCNA10     493 --STD-------------S--LNK------------------  499 
KCNB1      463 IVVEK-------------N--GEN------------------  471 
KCNB2      467 VAVEK-------------A--GES------------------  475 
KCNC1      492 --QEE-------------I--LEI------------------  498 
KCNC2      529 --DNR-------------L--LEH------------------  535 
KCNC3      650 --QEE-------------V--IEI------------------  656 
KCNC4      529 --EEG-------------M--IER------------------  535 
KCND1      496 -ELTF-------------S--EAL------------------  503 
KCND2      496 -EQVF-------------E--ESC------------------  503 
KCND3      513 -EQMF-------------E--QNC------------------  520 
KCNF1      454 PEPAG-------------------------------------  458 
KCNG1      509 TRDN--------------------------------------  512 
KCNG2      456 SADAL----------------WVR------------------  463 
KCNG3      436 ------------------------------------------  435 
KCNG4      504 VNDLI----------------LEG------------------  511 
KCNV1      481 --RLK-------------G--RER------------------  487 
KCNV2      541 PRQE--------------------------------------  544 
KCNS1      505 QEGQS-------------ADLESQ------------------  515 
KCNS2      457 ASLTN-------------M--SRS------------------  465 
KCNS3      453 TSLSS-------------V--GIV------------------  461 

cons      1009                                            1050 


KCNQ1      404 --------------------TLLSPSPKPKKSVVVKKKKFKL  425 
KCNQ2      404 AFRKDPPPEPSPSKGSPCRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDRV-F  444 
KCNQ3      413 ----------------------KEQLEAASSQKLGLLDRVRL  432 
KCNQ4      410 SRYPPVAT---------CHRPGSTSFCPGESSRMGIKDRIRM  442 
KCNQ5      400 -----LHT---------CSPTKKEQGEASSSQKLSFKERVRM  427 
KCNA1      458 ------------------------------------------  457 
KCNA2      462 ------------------------------------------  461 
KCNA3      533 ------------------------------------------  532 
KCNA4      615 ------------------------------------------  614 
KCNA5      586 ------------------------------------------  585 
KCNA6      502 ------------------------------------------  501 
KCNA7      438 ------------------------------------------  437 
KCNA10     500 ------------------------------------------  499 
KCNB1      472 ------------------------------------------  471 
KCNB2      476 ------------------------------------------  475 
KCNC1      499 ------------------------------------------  498 
KCNC2      536 ------------------------------------------  535 
KCNC3      657 ------------------------------------------  656 
KCNC4      536 ------------------------------------------  535 
KCND1      504 ------------------------------------------  503 
KCND2      504 ------------------------------------------  503 
KCND3      521 ------------------------------------------  520 
KCNF1      459 ------------------------------------------  458 
KCNG1      513 ------------------------------------------  512 
KCNG2      464 ------------------------------------------  463 
KCNG3      436 ------------------------------------------  435 
KCNG4      512 ------------------------------------------  511 
KCNV1      488 ------------------------------------------  487 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      516 ------------------------------------------  515 
KCNS2      466 ------------------------------------------  465 
KCNS3      462 ------------------------------------------  461 

cons      1051                                            1092 


KCNQ1      426 DKDN-GVTP-G----EKMLTVPHITCDPPEERRL--------  453 
KCNQ2      445 SSPR-GVAAKG----KGSPQAQTVRRSPSADQSLED-SPSKV  480 
KCNQ3      433 SNPR-GSNTKG----KL--------FTPLNVDAIEE-SPSKE  460 
KCNQ4      443 GSSQ-RRTGPS----KQHLAPPTMPTSPSSEQVGEATSPTKV  479 
KCNQ5      428 ASPR-GQSIKS----RQ--ASVGDRRSPSTDITAEG-SPTKV  461 
KCNA1      458 ---E-EDMNNS----IAHYRQV-NIR----------------  474 
KCNA2      462 ---Q-EGVNNSNE--D--FREE-NLK----------------  478 
KCNA3      533 ---E-EGGMNHSAFPQTPFKTG-N-S----------------  552 
KCNA4      615 ---E-EGVKES----LCAKEEKCQGK----------------  632 
KCNA5      586 ---C-N---VK----AKSNVD---------------------  595 
KCNA6      502 ---P-EANRER----RPSYLPT--------------------  515 
KCNA7      438 ---P-E-------------LPP-P------------------  443 
KCNA10     500 ---T-N------------G-----------------------  502 
KCNB1      472 ---M-GKKDKV----QDNHLSPNKWKWTKRTLSET-SSSKSF  504 
KCNB2      476 ---A-NTKDSA----DDNHLSPSRWKWARKALSET-SSNKSF  508 
KCNC1      499 ---N-RADSKLNG--EVAKAALANEDCPHID-----QA----  525 
KCNC2      536 ---N-RS-------------VLSGDDSTGSE-----PP----  551 
KCNC3      657 ---N-RADPRPNG--DPAAAALAHEDCPAID-----QPA---  684 
KCNC4      536 ---K-RADSKQNG--D-ANAVLSDEEGAGLT-----QPLASS  565 
KCND1      504 ---G-AVSPGG----R-TSRST-SVSSQPVGPGS--LLSSCC  533 
KCND2      504 ---M-EVATVN----RPSSHSP-SLSSQQ----G--VTSTCC  530 
KCND3      521 ---M-ESSMQN----YPSTRSP-SLSSHP----G--LTTTCC  547 
KCNF1      459 ---K-EAPSCS----SRLKLSHSDTF-------IP-LLTE--  482 
KCNG1      513 ----------N-------------------------------  513 
KCNG2      464 ---AG-----R-------------------------------  466 
KCNG3      436 ----------N-------------------------------  436 
KCNG4      512 ---PALPIMHM-------------------------------  519 
KCNV1      488 ---A-STRSSG----GDDF--------------W--------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      516 ---A-PSEPPH----PQM------------------------  525 
KCNS2      466 ---S-PSELSL----NDSL-----------------------  476 
KCNS3      462 ---V-SDPDST----DASSIEDNEDI-------CN-TTSLEN  487 

cons      1093                                            1134 


KCNQ1      454 DHFS---VDG------------YDSSVRKSPTLLEV---SMP  477 
KCNQ2      481 PKSW-----S------------FGDRSRARQAF------RIK  499 
KCNQ3      461 PKPV-----G------------LNNKERFRTAF------RMK  479 
KCNQ4      480 QKSW-----S------------FNDRTRFRASL------RLK  498 
KCNQ5      462 QKSW-----S------------FNDRTRFRPSL------RLK  480 
KCNA1      475 ------------------------------------------  474 
KCNA2      479 ------------------------------------------  478 
KCNA3      553 ------------------------------------------  552 
KCNA4      633 ------------------------------------------  632 
KCNA5      596 ------------------------------------------  595 
KCNA6      516 ------------------------------------------  515 
KCNA7      444 ------------------------------------------  443 
KCNA10     503 ------------------------------------------  502 
KCNB1      505 ETKEQGSPEKA-------RSSSS-PQH-----LNVQQLEDMY  533 
KCNB2      509 ENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSS-PQH-----LSAQKLEMLY  544 
KCNC1      526 L-----------------------------------------  526 
KCNC2      552 L-----------------------------------------  552 
KCNC3      685 M-----------------------------------------  685 
KCNC4      566 P-----------------------------------------  566 
KCND1      534 P-----------------------------------------  534 
KCND2      531 S-----------------------------------------  531 
KCND3      548 S-----------------------------------------  548 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      488 CTA---------------------------------------  490 

cons      1135                                            1176 


KCNQ1      478 -----------------HFMRTNSFAEDLDLEGETL------  496 
KCNQ2      500 G-------------AASRQNSEEASLPGEDIVDDKS------  522 
KCNQ3      480 A--------------YAFWQSSEDAGTGDPMAEDRG------  501 
KCNQ4      499 -----------------PRTSAEDA-PSEEVAEEKS------  516 
KCNQ5      481 S------------SQPKPVIDADTALGTDDVYDEKG------  504 
KCNA1      475 ------------------------------------------  474 
KCNA2      479 ------------------------------------------  478 
KCNA3      553 ------------------------------------------  552 
KCNA4      633 ------------------------------------------  632 
KCNA5      596 ------------------------------------------  595 
KCNA6      516 ------------------------------------------  515 
KCNA7      444 ------------------------------------------  443 
KCNA10     503 ------------------------------------------  502 
KCNB1      534 NKMAKTQ--SQPILNTKESAAQ-SKPKEELEMESIPSPVAPL  572 
KCNB2      545 NEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQL  586 
KCNC1      527 ------------------------------------------  526 
KCNC2      553 ------------------------------------------  552 
KCNC3      686 ------------------------------------------  685 
KCNC4      567 ------------------------------------------  566 
KCND1      535 ------------------------------------------  534 
KCND2      532 ------------------------------------------  531 
KCND3      549 ------------------------------------------  548 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1177                                            1218 


KCNQ1      497 ------------------------------------------  496 
KCNQ2      523 ------------------------------------------  522 
KCNQ3      502 ------------------------------------------  501 
KCNQ4      517 ------------------------------------------  516 
KCNQ5      505 ------------------------------------------  504 
KCNA1      475 ------------------------------------------  474 
KCNA2      479 ------------------------------------------  478 
KCNA3      553 ------------------------------------------  552 
KCNA4      633 ------------------------------------------  632 
KCNA5      596 ------------------------------------------  595 
KCNA6      516 ------------------------------------------  515 
KCNA7      444 ------------------------------------------  443 
KCNA10     503 ------------------------------------------  502 
KCNB1      573 P-TRTEGVIDMRSMSSIDSFISCATDFPEATRFSHSP---LT  610 
KCNB2      587 AVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASH  628 
KCNC1      527 ------------------------------------------  526 
KCNC2      553 ------------------------------------------  552 
KCNC3      686 ------------------------------------------  685 
KCNC4      567 ------------------------------------------  566 
KCND1      535 ------------------------------------------  534 
KCND2      532 ------------------------------------------  531 
KCND3      549 ------------------------------------------  548 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1219                                            1260 


KCNQ1      497 ------------------------------------------  496 
KCNQ2      523 ------------------------------------------  522 
KCNQ3      502 ------------------------------------------  501 
KCNQ4      517 ------------------------------------------  516 
KCNQ5      505 ------------------------------------------  504 
KCNA1      475 ------------------------------------------  474 
KCNA2      479 ------------------------------------------  478 
KCNA3      553 ------------------------------------------  552 
KCNA4      633 ------------------------------------------  632 
KCNA5      596 ------------------------------------------  595 
KCNA6      516 ------------------------------------------  515 
KCNA7      444 ------------------------------------------  443 
KCNA10     503 ------------------------------------------  502 
KCNB1      611 SLP------------SKTGGSTAPEVGW-RGALGASGG---R  636 
KCNB2      629 LQMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYA  670 
KCNC1      527 ------------------------------------------  526 
KCNC2      553 ------------------------------------------  552 
KCNC3      686 ------------------------------------------  685 
KCNC4      567 ------------------------------------------  566 
KCND1      535 ------------------------------------------  534 
KCND2      532 ------------------------------------------  531 
KCND3      549 ------------------------------------------  548 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1261                                            1302 


KCNQ1      497 -------------------------LTPITHISQLREHHRAT  513 
KCNQ2      523 -------------------------CPCEFVTEDLTPGLKVS  539 
KCNQ3      502 -------------------------YGNDFPIEDMIPTLKAA  518 
KCNQ4      517 -------------------------YQCELTVDDIMPAVKTV  533 
KCNQ5      505 -------------------------CQCDVSVEDLTPPLKTV  521 
KCNA1      475 --------------------------TAN----CTTAN--QN  484 
KCNA2      479 --------------------------TAN----CTLAN--TN  488 
KCNA3      553 --------------------------TAT----CTTNNNPNS  564 
KCNA4      633 --------------------------GDD----SETDK--NN  642 
KCNA5      596 ------------------------------------------  595 
KCNA6      516 ----------------------------------P-----HR  518 
KCNA7      444 ----------------------------------------LW  445 
KCNA10     503 ------------------------------------------  502 
KCNB1      637 F--VEANPSPD-------ASQHSSFFIESPKSSMKTNNPLKL  669 
KCNB2      671 PVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLKGSNPLKS  712 
KCNC1      527 -------------------------TPDEGLPFTRSGTRERY  543 
KCNC2      553 -------------------------SPPERLPIRRSSTRDKN  569 
KCNC3      686 -------------------------SPEDKSPIT-PGSRGRY  701 
KCNC4      567 -------------------------TPEERRALRRSTTRDRN  583 
KCND1      535 -------------------------RRAKRRAIRLANSTASV  551 
KCND2      532 -------------------------RRHK-KTFRIPNANVSG  547 
KCND3      549 -------------------------RRSK-KTTHLPNSNLPA  564 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1303                                            1344 


KCNQ1      514 IKVIRRMQ----------YFVAKKKFQQARKPYDVRDVIEQY  545 
KCNQ2      540 IRAVCVMR----------FLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQY  571 
KCNQ3      519 IRAVRILQ----------FRLYKKKFKETLRPYDVKDVIEQY  550 
KCNQ4      534 IRSIRILK----------FLVAKRKFKETLRPYDVKDVIEQY  565 
KCNQ5      522 IRAIRIMK----------FHVAKRKFKETLRPYDVKDVIEQY  553 
KCNA1      485 CVNKSKLL----------TD----------------------  494 
KCNA2      489 YVNITKML----------TD----------------------  498 
KCNA3      565 CVNIKKIF----------TD----------------------  574 
KCNA4      643 CSNAKAVE----------TD----------------------  652 
KCNA5      596 ---LRRSLYALCLDTSRETD----------------------  612 
KCNA6      519 AYAEKRML----------TE----------------------  528 
KCNA7      446 APPGKHLV----------TE----------------------  455 
KCNA10     503 --GCSTEK----------SR----------------------  510 
KCNB1      670 RALKVNFM----------EG-------DPSPLLPVLGMYHDP  694 
KCNB2      713 RSLKVNFK----------ENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADF  744 
KCNC1      544 --GP-CFL----------LSTGEYACPPGGGMRK--------  564 
KCNC2      570 RRGETCFL----------LTTGDYTCASDGGIRKG----YEK  597 
KCNC3      702 SRDRACFL----------LT--DYAPSPDGSIRKATGAPPLP  731 
KCNC4      584 KKAAACFL----------LSTGDYACA-DGSVRKG----TFV  610 
KCND1      552 S-RGSMQE----------LDMLA--GLRRSHAPQSRSSLNAK  580 
KCND2      548 SHQGSIQE----------LSTIQIRCVERTPLSNSRSSLNAK  579 
KCND3      565 TRLRSMQE----------LSTIHIQGSEQPSLTTSRSSLNLK  596 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1345                                            1386 


KCNQ1      546 SQGHLNLMVRIKELQRRL----------------DQSIGKPS  571 
KCNQ2      572 SAGHLDMLSRIKSLQSRV----------------DQIVGRGP  597 
KCNQ3      551 SAGHLDMLSRIKYLQTRI----------------DMIFTPGP  576 
KCNQ4      566 SAGHLDMLGRIKSLQTRV----------------DQIVGRGP  591 
KCNQ5      554 SAGHLDMLCRIKSLQTRV----------------DQILGKGQ  579 
KCNA1      495 ------------------------------------------  494 
KCNA2      499 ------------------------------------------  498 
KCNA3      575 ------------------------------------------  574 
KCNA4      653 ------------------------------------------  652 
KCNA5      613 ------------------------------------------  612 
KCNA6      529 ------------------------------------------  528 
KCNA7      456 ------------------------------------------  455 
KCNA10     511 ------------------------------------------  510 
KCNB1      695 LRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLSPESSIYTTASAKTPP-  735 
KCNB2      745 SLTTPQHISTILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGPSKGLS-  785 
KCNC1      565 --DLCKESP---VIAKYM------------------------  577 
KCNC2      598 SRSLNNIAGLAGNALRLS------------------------  615 
KCNC3      732 PQDWRKPGPPS-FLPDLN------------------------  748 
KCNC4      611 LRDLPLQHSP---EAACP------------------------  625 
KCND1      581 PHDSLDLNCDSRDFVAAI----------------ISIPTPP-  605 
KCND2      580 MEECVKLNCEQPYVTTAI----------------ISIPTPP-  604 
KCND3      597 ADDGLRPNCKTSQITTAI----------------ISIPTPP-  621 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1387                                            1428 


KCNQ1      572 LFIS-----------V-----------------SEKSKDRGS  585 
KCNQ2      598 AITD--KDR--T--KG-----------------PAEAELPED  616 
KCNQ3      577 PSTP--KHKKSQKGSAFTFPSQQSPRNEPYVARPSTSEI-ED  615 
KCNQ4      592 GDRKAREKG--D--KG-----------------PSDAEVVDE  612 
KCNQ5      580 ITSD-KKSR--E--KI-----------------TAEHETTDD  599 
KCNA1      495 ------------------------------------------  494 
KCNA2      499 ------------------------------------------  498 
KCNA3      575 ------------------------------------------  574 
KCNA4      653 ------------------------------------------  652 
KCNA5      613 ------------------------------------------  612 
KCNA6      529 ------------------------------------------  528 
KCNA7      456 ------------------------------------------  455 
KCNA10     511 ------------------------------------------  510 
KCNB1      736 ------------------------------------------  735 
KCNB2      786 ------------------------------------------  785 
KCNC1      578 ------------------------------------------  577 
KCNC2      616 ------------------------------------------  615 
KCNC3      749 ------------------------------------------  748 
KCNC4      626 ------------------------------------------  625 
KCND1      606 ------------------------------------------  605 
KCND2      605 ------------------------------------------  604 
KCND3      622 ------------------------------------------  621 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1429                                            1470 


KCNQ1      586 NTIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTP--  625 
KCNQ2      617 PSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAY  658 
KCNQ3      616 QSMMGKFVKVERQVQDMGKKLDFLVDMHMQHMERLQVQVTEY  657 
KCNQ4      613 ISMMGRVVKVEKQVQSIEHKLDLLLGFYSRCLRSGTSAS--L  652 
KCNQ5      600 LSMLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALAL  641 
KCNA1      495 ------------------------------------------  494 
KCNA2      499 ------------------------------------------  498 
KCNA3      575 ------------------------------------------  574 
KCNA4      653 ------------------------------------------  652 
KCNA5      613 ------------------------------------------  612 
KCNA6      529 ------------------------------------------  528 
KCNA7      456 ------------------------------------------  455 
KCNA10     511 ------------------------------------------  510 
KCNB1      736 ------------------------------------------  735 
KCNB2      786 ------------------------------------------  785 
KCNC1      578 ------------------------------------------  577 
KCNC2      616 ------------------------------------------  615 
KCNC3      749 ------------------------------------------  748 
KCNC4      626 ------------------------------------------  625 
KCND1      606 ------------------------------------------  605 
KCND2      605 ------------------------------------------  604 
KCND3      622 ------------------------------------------  621 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1471                                            1512 


KCNQ1      626 --------------GSGGPPREGG--------AHITQPCGSG  645 
KCNQ2      659 --FG--AKEPEPAPPYHSPEDSREH---VDRHGCIVKIVRSS  693 
KCNQ3      658 ----------YPTKGTSSPAEAEK--KEDNRYSDLKTIICNY  687 
KCNQ4      653 GAVQVPLFDPDITSDYHSPVDHEDISVSAQTL-SISRSVSTN  693 
KCNQ5      642 ASFQIPPFECEQTSDYQSPVDSKDLSGSAQNSGCLSRSTSAN  683 
KCNA1      495 ------------------------------------------  494 
KCNA2      499 ------------------------------------------  498 
KCNA3      575 ------------------------------------------  574 
KCNA4      653 ------------------------------------------  652 
KCNA5      613 ------------------------------------------  612 
KCNA6      529 ------------------------------------------  528 
KCNA7      456 ------------------------------------------  455 
KCNA10     511 ------------------------------------------  510 
KCNB1      736 ------------------------------------------  735 
KCNB2      786 ------------------------------------------  785 
KCNC1      578 ------------------------------------------  577 
KCNC2      616 ------------------------------------------  615 
KCNC3      749 ------------------------------------------  748 
KCNC4      626 ------------------------------------------  625 
KCND1      606 ------------------------------------------  605 
KCND2      605 ------------------------------------------  604 
KCND3      622 ------------------------------------------  621 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1513                                            1554 


KCNQ1      646 GS----------------------------------------  647 
KCNQ2      694 SSTGQ------------------KNFSAPPAAPPVQCPPSTS  717 
KCNQ3      688 SETGPPEPP---------------YSFHQVTIDKVSPYGFFA  714 
KCNQ4      694 M-----------------------------------------  694 
KCNQ5      684 ISRGLQFILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQATQVPISQSDGSA  725 
KCNA1      495 ------------------------------------------  494 
KCNA2      499 ------------------------------------------  498 
KCNA3      575 ------------------------------------------  574 
KCNA4      653 ------------------------------------------  652 
KCNA5      613 ------------------------------------------  612 
KCNA6      529 ------------------------------------------  528 
KCNA7      456 ------------------------------------------  455 
KCNA10     511 ------------------------------------------  510 
KCNB1      736 ----------RSPEKHTAIAFNF-------------------  748 
KCNB2      786 ----------PRFPKQKLFPFSS-------------------  798 
KCNC1      578 ------------------------------------------  577 
KCNC2      616 ------------------------------------------  615 
KCNC3      749 ------------------------------------------  748 
KCNC4      626 ------------------------------------------  625 
KCND1      606 ------------------------------------------  605 
KCND2      605 ------------------------------------------  604 
KCND3      622 ------------------------------------------  621 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1555                                            1596 


KCNQ1      648 ---------------------------VD-------------  649 
KCNQ2      718 WQPQSHPRQG----H-GTSPVGDHGSLVRIPPP-PAHERS--  751 
KCNQ3      715 HDPVNLPRGGPSSGKVQATPPSSATTYVERPTVLPILTLL--  754 
KCNQ4      695 ------------------------------------------  694 
KCNQ5      726 VAATNTIANQ----I-NTAPKPAAPTTLQIPPPLPAIKHLPR  762 
KCNA1      495 ------------------------------------------  494 
KCNA2      499 ------------------------------------------  498 
KCNA3      575 ------------------------------------------  574 
KCNA4      653 ------------------------------------------  652 
KCNA5      613 ------------------------------------------  612 
KCNA6      529 ------------------------------------------  528 
KCNA7      456 ------------------------------------------  455 
KCNA10     511 ------------------------------------------  510 
KCNB1      749 --------------------------------------EA--  750 
KCNB2      799 --------------------------------------RE--  800 
KCNC1      578 ------------------------------------------  577 
KCNC2      616 ------------------------------------------  615 
KCNC3      749 ------------------------------------------  748 
KCNC4      626 ------------------------------------------  625 
KCND1      606 ------------------------------------------  605 
KCND2      605 ------------------------------------------  604 
KCND3      622 ------------------------------------------  621 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1597                                            1638 


KCNQ1      650 ------------------------------------------  649 
KCNQ2      752 ------------------LSAYGGGNRASM---EFLRQEDTP  772 
KCNQ3      755 ------------------DSRVSCHSQADL---QG-PYSDRI  774 
KCNQ4      695 ------------------------------------------  694 
KCNQ5      763 PETLHPNPAGLQESISDVTTCLVASKENVQ---VA-QSNLTK  800 
KCNA1      495 ------------------------------------------  494 
KCNA2      499 ------------------------------------------  498 
KCNA3      575 ------------------------------------------  574 
KCNA4      653 ------------------------------------------  652 
KCNA5      613 ------------------------------------------  612 
KCNA6      529 ------------------------------------------  528 
KCNA7      456 ------------------------------------------  455 
KCNA10     511 ------------------------------------------  510 
KCNB1      751 ------------------GVHQYIDADTDD---EG-QLLYSV  770 
KCNB2      801 ------------------R-RSFTEIDTGDDEDFL-ELPGAR  822 
KCNC1      578 ------------------------------------------  577 
KCNC2      616 ------------------------------------------  615 
KCNC3      749 ------------------------------------------  748 
KCNC4      626 ------------------------------------------  625 
KCND1      606 ------------------------------------------  605 
KCND2      605 ------------------------------------------  604 
KCND3      622 ------------------------------------------  621 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1639                                            1680 


KCNQ1      650 -----------------------PELFLPS----NTLPTYEQ  664 
KCNQ2      773 GCR-PPEGNLRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKEN  813 
KCNQ3      775 SPR-QRRSITRDSDTPLSLMSVNHEELERSPSGFSISQDRDD  815 
KCNQ4      695 ------------------------------------------  694 
KCNQ5      801 DRS-MRKSFDMGGETLLSVCPMVPKDLGKSLSVQNLIRSTEE  841 
KCNA1      495 ------------------------------------------  494 
KCNA2      499 ------------------------------------------  498 
KCNA3      575 ------------------------------------------  574 
KCNA4      653 ------------------------------------------  652 
KCNA5      613 ------------------------------------------  612 
KCNA6      529 ------------------------------------------  528 
KCNA7      456 ------------------------------------------  455 
KCNA10     511 ------------------------------------------  510 
KCNB1      771 DSS-PPK---SLPGSTSPKFSTG--TRSEKNHFESSPLPTSP  806 
KCNB2      823 EEKQVD----SSPNCFADKPSDGRDPLREEGSVGSSSPQDTG  860 
KCNC1      578 ------------------------------------------  577 
KCNC2      616 ------------------------------------------  615 
KCNC3      749 ------------------------------------------  748 
KCNC4      626 ------------------------------------------  625 
KCND1      606 ------A---NTPD-----ESQPSSPGGGGRAGSTLRNSSLG  633 
KCND2      605 ------V---TTPE-------------GDDRPE--SP-----  617 
KCND3      622 ------A---LTPE-------------GESRPPPASPGPNTN  641 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1681                                            1722 


KCNQ1      665 LTVPRRGPDEGS------------------------------  676 
KCNQ2      814 LDALNSCYAAVAPCAK---------VRPYIAEGES---DTDS  843 
KCNQ3      816 YVFGPNGGSS---WMR---------EKRYLAEGET---DTDT  842 
KCNQ4      695 ------------------------------------------  694 
KCNQ5      842 LNIQLSGSESSGSRGSQDFYPKWRESKLFITDEEVGPEETET  883 
KCNA1      495 ------------------------------------------  494 
KCNA2      499 ------------------------------------------  498 
KCNA3      575 ------------------------------------------  574 
KCNA4      653 ------------------------------------------  652 
KCNA5      613 ------------------------------------------  612 
KCNA6      529 ------------------------------------------  528 
KCNA7      456 ------------------------------------------  455 
KCNA10     511 ------------------------------------------  510 
KCNB1      807 KFLRQNCIYSTEALTGKGPSGQEKC-----KL--------EN  835 
KCNB2      861 HNCRQDI-YHAVSEVKKD-SSQEGC-----KM--------EN  887 
KCNC1      578 ----PT------------------------------------  579 
KCNC2      616 ----PV------------------------------------  617 
KCNC3      749 ----AN------------------------------------  750 
KCNC4      626 ----PT------------------------------------  627 
KCND1      634 TPCLFP------------------------------------  639 
KCND2      618 -EYSGG------------------------------------  622 
KCND3      642 IPSIAS------------------------------------  647 
KCNF1      483 ------------------------------------------  482 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1723                                            1764 


KCNQ1      677 ------------------------------------------  676 
KCNQ2      844 DLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPR--------------  871 
KCNQ3      843 DPFTPSGSMPLSSTGDG-ISDSVWTPSNKP------------  871 
KCNQ4      695 ------------------------------------------  694 
KCNQ5      884 DTFDAAPQPAREAAFASDSLRTGRSRSSQSICKAGESTDALS  925 
KCNA1      495 ------------------------------------------  494 
KCNA2      499 ------------------------------------------  498 
KCNA3      575 ------------------------------------------  574 
KCNA4      653 ------------------------------------------  652 
KCNA5      613 ------------------------------------------  612 
KCNA6      529 ------------------------------------------  528 
KCNA7      456 ------------------------------------------  455 
KCNA10     511 ------------------------------------------  510 
KCNB1      836 HI-SPDV-------------------------RVLPGGGAHG  851 
KCNB2      888 HLFAPEI-------------------------HSNPGDTGYC  904 
KCNC1      580 -----------------------------------------E  580 
KCNC2      618 -----------------------------------------T  618 
KCNC3      751 -----------------------------------------A  751 
KCNC4      628 -----------------------------------------A  628 
KCND1      640 -----------------------------------------E  640 
KCND2      623 -----------------------------------------N  623 
KCND3      648 -----------------------------------------N  648 
KCNF1      483 -------------------------------------EKHHR  487 
KCNG1      514 ------------------------------------------  513 
KCNG2      467 ------------------------------------------  466 
KCNG3      437 ------------------------------------------  436 
KCNG4      520 ------------------------------------------  519 
KCNV1      500 ------------------------------------------  499 
KCNV2      545 ------------------------------------------  544 
KCNS1      526 ------------------------------------------  525 
KCNS2      477 ------------------------------------------  476 
KCNS3      491 ------------------------------------------  490 

cons      1765                                            1806 


KCNQ1      677 --------------------  676 
KCNQ2      872 ------K-------------  872 
KCNQ3      872 ------I-------------  872 
KCNQ4      695 ------D-------------  695 
KCNQ5      926 LPHVKLK-------------  932 
KCNA1      495 -------------------V  495 
KCNA2      499 -------------------V  499 
KCNA3      575 -------------------V  575 
KCNA4      653 -------------------V  653 
KCNA5      613 -------------------L  613 
KCNA6      529 -------------------V  529 
KCNA7      456 -------------------V  456 
KCNA10     511 -------------------K  511 
KCNB1      852 STRDQSI-------------  858 
KCNB2      905 PTRETSM-------------  911 
KCNC1      581 AVRV---------------T  585 
KCNC2      619 SPYNSPCPLRRSRSPIPSIL  638 
KCNC3      752 AAWIS--------------P  757 
KCNC4      629 GTLFLP-------------H  635 
KCND1      641 TVKISS-------------L  647 
KCND2      624 IVRVSA-------------L  630 
KCND3      649 VVKVSA-------------L  655 
KCNF1      488 TRLQSCK-------------  494 
KCNG1      514 --------------------  513 
KCNG2      467 --------------------  466 
KCNG3      437 --------------------  436 
KCNG4      520 --------------------  519 
KCNV1      500 ------F-------------  500 
KCNV2      545 ------N-------------  545 
KCNS1      526 ------Y-------------  526 
KCNS2      477 ------R-------------  477 
KCNS3      491 ------K-------------  491 

cons      1807                      1826